3 数据预处理
3.1 计算重要值
我们定义了四种计算重要值的方式,默认 method=3,herb为要求格式的样方数据
| 代码 | 公式 | 所需数据 |
|---|---|---|
| HERBIV(herb,method=3) | IV=RB+RH+RA | 生物量+高度+密度 |
| HERBIV(herb,method=3.1) | IV=RB+RH+RC | 生物量+高度+盖度 |
| HERBIV(herb,method=2) | IV=RB+RH | 生物量+高度 |
| HERBIV(herb,method=1) | IV=RB | 生物量 |
- 计算重要值，产生格式为==样方、物种、重要值矩阵==，空值为NA
- 其格式符合vegan和picante等包的要求格式，如果需要将NA替换为0，可用以下代码’com[is.na(com)]<-0’
com<-HERBIV(plantcom$comm)