lebook
1
前言
1.1
出发点
1.2
安装
2
数据
2.1
样方
2.2
物种信息
2.2.1
内蒙植物名录
3
数据预处理
3.1
计算重要值
4
区系
4.1
科属组成
4.2
生活型
4.3
水分生态型
4.4
区系地理
4.5
恒有度
4.6
重要值等级
4.7
SAR种面积曲线
5
群落
6
群从划分
6.1
按照排位IV
6.2
按照累积IV
6.3
群从划分表
6.4
群从名,写出群从的中文名,拉丁名,和所含样地号
6.5
按群从组统计数量特征
6.6
群从组的物种组成,返回list
6.7
按群从统计数量特征
6.7.1
群落结构分层图解
6.8
群从物种组成描述
7
批量输出
8
环境
8.1
经纬度格式转化
8.2
WC气候因子提取
8.3
spocc包
8.4
根据经纬度,解析行政地址
9
多样性计算
9.1
α多样性
9.2
多样性与环境因子之间的相关性
9.3
β多样性
10
种间关系
10.1
SPAA包
10.2
种间关系数据筛选
10.3
种间关系可视化
11
绘制地图
12
物种分布
12.1
GBIF物种分布
12.2
CVH物种分布
github lebook
lebook文档
10
种间关系
10.1
SPAA包
SPAA介绍
10.2
种间关系数据筛选
by
len
hyd
根据恒有度,筛选几个物种
hyd1
根据恒有度,筛选前百分之几
iv
根据累计重要值,筛选几个物种
iv1
根据累计重要值,筛选前百分之几
zj<-
subsp
(com,
by=
"hyd"
,
len=
10
)
CORB
(
as.data.frame
(zj),
by=
"pearson"
)
10.3
种间关系可视化
corrplot
ggcorrplot