lebook
1
前言
1.1
出发点
1.2
安装
2
数据
2.1
样方
2.2
物种信息
2.2.1
内蒙植物名录
3
数据预处理
3.1
计算重要值
4
区系
4.1
科属组成
4.2
生活型
4.3
水分生态型
4.4
区系地理
4.5
恒有度
4.6
重要值等级
4.7
SAR种面积曲线
5
群落
6
群从划分
6.1
按照排位IV
6.2
按照累积IV
6.3
群从划分表
6.4
群从名,写出群从的中文名,拉丁名,和所含样地号
6.5
按群从组统计数量特征
6.6
群从组的物种组成,返回list
6.7
按群从统计数量特征
6.7.1
群落结构分层图解
6.8
群从物种组成描述
7
批量输出
8
环境
8.1
经纬度格式转化
8.2
WC气候因子提取
8.3
spocc包
8.4
根据经纬度,解析行政地址
9
多样性计算
9.1
α多样性
9.2
多样性与环境因子之间的相关性
9.3
β多样性
10
种间关系
10.1
SPAA包
10.2
种间关系数据筛选
10.3
种间关系可视化
11
绘制地图
12
物种分布
12.1
GBIF物种分布
12.2
CVH物种分布
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10
种间关系
10.1
SPAA包
SPAA介绍
10.2
种间关系数据筛选
by
len
hyd
根据恒有度,筛选几个物种
hyd1
根据恒有度,筛选前百分之几
iv
根据累计重要值,筛选几个物种
iv1
根据累计重要值,筛选前百分之几
zj<-
subsp
(com,
by=
"hyd"
,
len=
10
)
CORB
(
as.data.frame
(zj),
by=
"pearson"
)
10.3
种间关系可视化
corrplot
ggcorrplot